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CUPO LIMITADO 10 PERSONAS.

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Costo Estudiantes: $15.00 USD Para poder inscribirte como estudiante deberás contactarnos por Facebook o al correo: courses@icasat.com.mx

¡Early inscription: $11.00 USD hasta el 28 de abril!

** Preferente conocimientos básicos sobre manejo de línea de comandos de linux**

¿A quién va dirigido este curso?

Estudiantes de licenciatura y posgrado, profesionistas e interesados en el área.

Idioma: español

Fecha de impartición: Miércoles12 al viernes 14 de Mayo, 5 a 7 pm.

Objetivo:

Al término del curso los participantes tendrán:

Conocimientos teóricos y prácticos del análisis de calidad y limpieza de lecturas de secuenciación (archivos fastqc).

Conocimientos básicos (teóricos y prácticos) del ensamble de genomas.

Software requerido:

Sesión 1

Introducción (30 minutos)

FastQC: análisis de calidad de lecturas (30 minutos)

Trimmomatic: limpieza de lecturas (20 minutos)

QUAST: evaluador de ensamble de genomas (15 minutos)

Sesión 2

Ensamble con Velvet (1 hora)

Ensamble con VelvetOptimiser (30 minutos)

Sesión 3

Ensamble con Spades (30 minutos)

Comparación de ensambles (30 minutos)

Sobre los instructores:

IBT Mayra Karina Cándido Mireles

Ingeniera Biotecnóloga por el IPN (UPIIG) con experiencia en técnicas de transformación genética y biología molecular, así como colaboración en la industria química automotriz.

Estudiante de Maestría en Tecnología Avanzada por el CICATA-IPN campus Querétaro, llevando a cabo un proyecto para la identificación de fitopatógenos y estrés en vid utilizando técnicas de PCR y redes neuronales de aprendizaje profundo.

Conocimiento en bioinformática general enfocada en análisis filogenéticos, ensamble de genomas y metagenómica.

M. en C Veronica Segovia Tagle

Ingeniera Bioquímica y M. en C. en Ingeniería Bioquímica por el ITD, candidata a Doctora por el CICATA-IPN campus Querétaro; profesora investigadora de la UPIIZ-IPN campus Zacatecas, experta en microbiología y biotecnología con experiencia en bioinformática enfocada al ensamble y anotación de genomas.

M. en T.A. Dagoberto Pulido

Maestro en Tecnología Avanzada por el IPN (CICATA Querétaro).

Programador certificado de proyectos de inteligencia artificial y visión por computadora.

Amplio desarrollo científico en redes neuronales de aprendizaje profundo.

Colaboración con proyectos de visión por computadora en el MIT:

En el departamento de aeronáutica y astronáutica (AeroAstro) en 2018

En el laboratorio de información y sistemas de decisiones (LIDS) en 2019

Experiencia en la industria como desarrollador de software.

¡Ganate una beca!

El mircoles de Mayo se estará realizando una clase muestra en nuestra página de Facebook @iCASAT2021. Al finalizar la clase se realizará una dinámica para ganar becas.

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